2001年設立醫學檢驗技術五年制本科專業，2005年成立醫學檢驗系，同年獲批“臨床檢驗診斷學”碩士學位授權點，2011年開始在四川省一本招生。2013年、2014年及2020年相繼獲批四川省教育廳“本科專業綜合改革試點”專業，“國家住院醫師規范化培訓基地”及四川省“一流本科”專業建設點。醫學檢驗系于2020年10月實行系科合一，旨在培養具有臨床、教學、科研、管理及服務能力的高級復合型人才。現設有學生科、黨政辦及臨床生物化學、臨床檢驗基礎、臨床免疫學、臨床分子遺傳、臨床微生物五個教研室，陶華林、劉靳波先后任系主任。目前，該團隊主要承擔臨床生物化學檢驗技術、臨床基礎檢驗學技術、臨床微生物學檢驗技術、臨床免疫學檢驗技術、臨床分子生物學檢驗技術、臨床輸血學檢驗技術、臨床檢驗儀器與技術、臨床血液學檢驗技術、臨床實驗室管理、醫學遺傳學、診斷學等專業課程。承擔檢驗系理論與實驗教學任務（1500學時/年），招收檢驗專業規范化培訓學員10余人/年，帶教實習生40余人/年，培養碩士研究生20余人/年。

檢驗系現有在讀研究生44人，本科生454人?，F有教師50余人，其中教授、副教授21人，講師17人，助教12人；博士7人，碩士35人；博士生導師1人，碩士生導師7人，國家（省級）專委會主任委員、副主任委員共6人；四川省學術和技術帶頭人后備人選3人，四川省衛健委學術技術帶頭人及后備人選2人。

學科已形成4個穩定方向：分子腫瘤學與腫瘤的分子診斷、輸血醫學、生物標志物檢測新方法及應用機制研究、臨床生化室內質量控制、代謝性疾病的研究。該團隊先后主持國家自然科學基金（含青年基金）4項，四川省科技廳項目近20項，市廳級項目40余項，發表SCI論文50余篇，核心論文100余篇，申請國家發明專利（含實用新型）30余項，其中授權10余項，主編或參編國家級、省級教材5部。2011年獲瀘州市科技進步獎特等獎、2012年獲四川省科技進步獎三等獎、2019年獲四川省醫學科技進步獎二等獎、四川省醫學科技進步獎二等獎（青年），2020年獲四川省醫學科技進步獎二等獎。