控制科學與工程學科，在2006年獲得一級學科碩士學位授予權。其二級學科“控制理論與控制工程”年同時獲批省級重點學科。
 本學科依托國家綠色鍍膜技術與裝備工程技術研究中心、光電技術與智能控制教育部重點實驗室（蘭州交通大學）、甘肅省高原交通信息工程及控制重點實驗室、甘肅省物流及運輸裝備信息化工程技術研究中心等省部級以上重點實驗室和工程技術研究中心以及機電技術研究所等科研機構，在研究生培養和學術研究方面取得了十分顯著的成績，并已形成穩定的具有一定特色的研究方向。主要研究領域涉及控制理論與控制工程、模式識別與智能系統、檢測技術與自動化裝置等。主要研究方向包括復雜系統建模、控制與優化以人工智能、先進控制理論及應用、模式識別與智能系統、智能機器人技術與應用、檢測技術與系統設計、機械（車輛）設備狀態監測與故障診斷等。